В университете утверждена и действует Программа по оздоровлению участников образовательного процесса и пропаганде здорового образа жизни в ВУЗе. Кроме этого для достижений целей формирования здорового образа жизни в университете приняты иные организационные меры, включенные в организационные документы других сфер.

Деятельность университета по развитию системы физического воспитания и занятий спортом предусмотрена Концепцией воспитательной работы и молодежной политики на 2013-2018 годы (утверждена решением Ученого Совета КрасГМУ, протокол №8 от 18.09.2013 г.) и включена в содержание комплексной Программы развития воспитательной работы и молодежной политики ГБОУ ВПО «Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого» Министерства здравоохранения Российской Федерации на 2015-2020 годы (утверждена решением Совета по воспитательной работе, протокол №2 от 28.10.2014 г.)