НИИ молекулярной медицины и патобиохимии был создан в КрасГМУ в 2006 году на базе Межкафедральной биохимической научно-исследовательской лаборатории (при кафедре биохимии с курсами медицинской, фармацевтической и токсикологической химии) в целях выполнения фундаментальных, поисковых и прикладных исследований по направлению «Молекулярная медицина и трансляционная медицина» в рамках междисциплинарных проектов с участием фундаментальных и клинических кафедр КрасГМУ, в сотрудничестве с ведущими российскими и зарубежными (Япония, Италия, Германия, Бразилия) научными центрами.