Закончила Красноярский медицинский институт в 1961 году. По окончании института в течении семи лет работала врачом в Канском онкологическом диспансере. В 1968 году пришла на преподавательскую работу на кафедру анатомии человека КрасМИ. С 1974 по 1977 год была учеба в аспирантуре, где под руководством академика Ю.И. Бородина Евгения Павловна защитила кандидатскую диссертацию «Морфофункциональная характеристика печеночных лимфоузлов в норме и при хроническом токсическом гепатите». После аспирантуры она вновь на кафедре анатомии, где прошла путь от ассистента до профессора. Талант ученого у Е.П. Шарайкиной в полной мере проявился, когда на кафедре началась разработка нового научного направления - биомедицинской и клинической антропологии. Сегодня она автор более 250 печатных работ, редактор трех сборников научных работ по интегративной антропологии, соавтор монографий, посвященных физическому статусу организма человека в различные периоды онтогенетического цикла. Под руководством Евгении Павловны защищены 11 кандидатских диссертаций. В 2005 успешно защитила научную работу на звание доктора мед.наук. Работа Шарайкиной Е.П. не ограничивается стенами кафедры. С 1983 по 1999 год она работала деканом на лечебном факультете. С 2002 по 2007 Е.П. Шарайкина начальник учебно-методического управления КрасГМА. В настоящее время работает на кафедре в должности профессора. Награждена медалью «Почетный педагог края», грамотами Правительства Российской Федерации и администрации города Красноярска.