Свое летоисчисление наш университет ведет с 21 ноября 1942 года, именно тогда, во времена разрушительных боевых действий, всеобъемлющего ужаса и людских страданий, согласно Приказу №558 Всесоюзного Комитета по делам Высшей школы при Совнаркоме СССР и Наркомата здравоохранения, были объединены эвакуированные в г. Красноярск части 1-го Ленинградского и 2-го Ленинградского медицинских институтов, Ленинградского педиатрического, Ленинградского стоматологического и Воронежского стоматологического институтов, - в один Красноярский медицинский институт.
С момента создания до 1958 года лечебный факультет был единственным факультетом в институте. В год открытия в состав лечебного факультета входило 33 кафедры, в том числе 17 общеобразовательных и 16 клинических. Клинические кафедры располагались на следующих базах: городская клиническая больница на 437 коек, хирургический корпус на 330 коек, родильный дом на 300 коек, венерологический диспансер, туберкулезный диспансер на 50 коек, зубоврачебные поликлиники №1 и №2, эвакуационные госпитали, санитарно-бактериологический институт.
Деканат лечебного факультета размещался в административном корпусе на ул. Карла Маркса, 124 до 1961 года, затем в новом главном корпусе по улице Партизана Железняка, 1. Первый выпуск на лечебном факультете и в институте состоялся в 1943 году – было подготовлено 47 врачей из числа эвакуированных студентов. Новый набор студентов на первый курс составил 100 человек. В связи с большой нуждой региона в медицинских кадрах набор на первый курс быстро увеличивался и с 1950 года составлял 400 человек. В течение 10 лет на лечебном факультете существовала вечерняя форма подготовки для лиц со средним медицинским образованием. Первым деканом лечебного факультета был назначен Иванов Владимир Николаевич (приказ №4 от 22.10.1942г.). Одновременно с этим Иванов В.Н. исполнял обязанности заведующего кафедрой социальной гигиены и общественного здравоохранения. В связи с переходом на лечебную работу проф. Иванова В.Н., с 27.03.1943г. исполняющим обязанности декана лечебного факультета назначена д.м.н. Шапиро Анна Исаевна – заведующая кафедрой микробиологии (приказ №62 от 20.05.1943г.). В течение 4-х месяцев Анна Исаевна руководила лечебным факультетом. С 10.07.1943г. по 01.09.1943г. была направлена в командировку для руководства бруцеллезной экспедицией в районах Красноярского края (приказ №90 от 12.07.1943г.) с освобождением от обязанностей декана.
С 05.07.1943г. исполняющим обязанности декана лечебного факультета был назначен Городецкий Александр Фомич заведующий кафедрой физики доцент, кандидат физико-математических наук. С 06.02.1944г. Городецкий Александр Фомич – освобожден от должности исполняющего обязанности декана лечебного факультета и назначен заведующим учебной частью с поручением выполнять деканские функции на 1-3 курсах лечебного факультета. Освобожден от занимаемой должности с 25.09.1944г. (приказ № 153 от 28.09.1944г.) – основание (распоряжение ГУМУЗА Наркомздрава СССР 360/334). Далее обязанности декана лечебного факультета исполнял Фой Аркадий Михайлович – профессор, д.м.н., заведующий кафедрой акушерства и гинекологии (приказ № 27 от 17.02.1944г.). Освобожден от занимаемой должности декана приказом № 126 от 17.08.1944г. на основании личного заявления. С 01.10.1944г. назначен деканом лечебного факультета Лихтенштейн Марк Осипович, доцент кожно-венерологической клиники с временным исполнением обязанностей заведующего кафедрой той же клиники. Марк Осипович обучался в Днепропетровском коммерческом училище, которое окончил в 1916г. В 1917г. поступил в Днепропетровский медицинский институт. Работал в вендиспансере до 1931г. В 1931г. был избран научным сотрудником Днепропетровского филиала Украинского дерматовенерологического института. В этом учреждении непрерывно работал на протяжении 10 лет до июня месяца 1941г. – научным сотрудником и заведующим клиникой. В июле 1941г. – пошел воевать в ряды Советской Армии – врач полевого госпиталя до 1942г., демобилизован, направлен в г. Красноярск. С марта 1942г. по октябрь 1944г. – заместитель заведующего Горздрава и доцент медицинского института. За время его работы дипломы врача получили 808 выпускников лечебного факультета. Марк Осипович активно участвовал в строительстве института, в организации и проведении противоэпидемических мероприятий по г. Красноярску. Работал деканом лечебного факультета до октября 1950 г. С 1950 г. по 1971 г. возглавлял лечебный факультет Топольский Виктор Николаевич. Виктор Николаевич родился в г. Ленинграде 23 июня 1905 г. В 1930 г. закончил медицинский факультет Первого Московского государственного университета. В 1942 году защитил кандидатскую диссертацию. С 1942 по 1946 год работал в Монгольском государственном университете деканом факультета и заведовал кафедрой нормальной анатомии. С 1946 по 1971 год работу декана лечебного факультета КГМИ совмещал с работой заведующего кафедрой нормальной анатомии. За 21 год на факультете подготовлен 4181 врач. Освобожден от должности декана 31.08.1971г. С 1971г. по 1974г. руководил факультетом профессор, заведующий кафедрой патологической анатомии и оперативной хирургии Бараков Владимир Яковлевич. За три года работы на факультете подготовлено 1233 врача.
С 1974г. по 1976г. возглавлял факультет Лобынцев Константин Сергеевич, за годы работы которого подготовлено 664 врача. Константин Сергеевич участник ВОВ, награжден орденом и многочисленными медалями. С 1976г. по 1985г. деканом факультета работал профессор, заведующий кафедрой глазных болезней Лазаренко Виктор Иванович. За время руководством факультета подготовлен 3131 врач. С 1985г. по сентябрь 2008 года факультетом руководила Турчина Тамара Константиновна, которая одновременно являлась доцентом кафедры хирургических болезней №2. Вместе с ней все эти годы заместителями декана работали д.м.н. Альберт Александрович Касимцев - профессор кафедры анатомии, к.м.н. Валерий Серафимович Медведев - доцент кафедры нормальной физиологии, Евгения Павловна Шарайкина - доцент кафедры нормальной анатомии (в настоящее время д.м.н., профессор), к.м.н. Левкович Любовь Геннадьевна - доцент кафедры физиологии им. проф. А.Т. Пшоника, д.м.н. Большаков Игорь Николаевич - профессор кафедры оперативной хирургии с топографической анатомией. С 22 сентября 1986 г. по ноябрь 1992г. заместителем декана лечебного факультета работал ассистент кафедры социальной гигиены и общественного здравоохранения Иван Павлович Артюхов. Период работы Т.К. Турчиной в деканате совпал с социально- экономическими реформами в стране, в том числе и с коренными реформами в высшем образовании. С ее участием на факультете и в университете разработаны и внедрены современные технологии в медицинском образовании: письменный и тестовый, а затем компьютерный контроль, оценка практических знаний и умений в отдельной зачетной книжке, трехэтапный экзамен по всем дисциплинам учебного плана. Внедрение бейджиков для преподавателей и студентов было идеей и инициативой лечебного факультета под руководством Т.К. Турчиной. Так была создана традиция, подчеркнувшая интеллигентность и корпоративность лечебного факультета, а затем и всего университета. Именно Т.К. Турчина во главе Ученого совета лечебного факультета выступила с инициативой перед Ученым советом академии, о присвоении Красноярской государственной медицинской академии имени Валентина Феликсовича Войно-Ясенецкого. С 2008 года университет носит имя святителя Луки, профессора В.Ф Войно-Ясенецкого. За время руководства лечебным факультетом Т.К. Турчиной было выпущено 7700 врачей.
С 01.09.2008 г. по 25.10.2010 г. обязанности декана лечебного факультета исполнял профессор, д.м.н. Горбунов Николай Станиславович. За время руководства факультетом Н.С. Горбунов внедрил публикацию типографским способом материалов Ученого совета лечебного факультета, проводил тщательную аналитическую работу с целью научной организации учебного процесса. Н.С.Горбунов ввел традицию проведения на лечебном факультете «Последнего звонка».
С октября 2010 года по октябрь 2013 года возглавлял факультет к.м.н. Зуков Руслан Александрович, одновременно являвшийся доцентом кафедры онкологии и лучевой терапии с курсом ПО. За время работы Зукова Р.А. появились группы углублённого изучения хирургии, а также акушерства и гинекологии, увеличилось количество учебных олимпиад.
С ноября 2013 года факультет возглавлял д.м.н., заведующий кафедрой мобилизационной подготовки здравоохранения, медицины катастроф и скорой помощи Штегман Олег Анатольевич.
В августе 2016г. деканом назначен к.м.н. Газенкампф Андрей Александрович.
С марта 2022 г. деканом стал д.м.н., доцент Наркевич Артем Николаевич, заведовавший кафедрой медицинской кибернетики и информатики.
В феврале 2023 года лечебный факультет возглавила к.фарм.н., доцент кафедры биологической химии с курсами медицинский, фармацевтической и токсикологической химии Харитонова Екатерина Викторовна.